Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp1a4Q9WV27 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp1a4Q9WV27 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms