Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ5

Tnni1, Troponin I, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni1Q9WUZ5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tnni1Q9WUZ5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnni1Q9WUZ5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnni1Q9WUZ5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnni1Q9WUZ5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnni1Q9WUZ5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnni1Q9WUZ5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnni1Q9WUZ5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnni1Q9WUZ5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnni1Q9WUZ5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnni1Q9WUZ5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnni1Q9WUZ5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnni1Q9WUZ5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnni1Q9WUZ5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms