Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trex2Q9R1A9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trex2Q9R1A9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms