Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rdh11Q9QYF1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rdh11Q9QYF1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Rdh11Q9QYF1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rdh11Q9QYF1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rdh11Q9QYF1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
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