Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rai2Q9QVY8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rai2Q9QVY8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms