Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF7

Hpgds, Hematopoietic prostaglandin D synthase, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpgdsQ9JHF7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpgdsQ9JHF7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpgdsQ9JHF7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms