Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER73

Elp4, Elongator complex protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp4Q9ER73 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Elp4Q9ER73 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Elp4Q9ER73 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms