Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r46Q9EQ45 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r46Q9EQ45 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r46Q9EQ45 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms