Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD06

Rarres2, Retinoic acid receptor responder protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres2Q9DD06 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rarres2Q9DD06 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rarres2Q9DD06 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms