Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg7Q9D906 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg7Q9D906 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg7Q9D906 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms