Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D7E4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D7E4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D7E4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D7E4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D7E4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D7E4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D7E4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D7E4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms