Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V5

Cul5, Cullin-5, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul5Q9D5V5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cul5Q9D5V5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cul5Q9D5V5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cul5Q9D5V5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cul5Q9D5V5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul5Q9D5V5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul5Q9D5V5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul5Q9D5V5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul5Q9D5V5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul5Q9D5V5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul5Q9D5V5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul5Q9D5V5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul5Q9D5V5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul5Q9D5V5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul5Q9D5V5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul5Q9D5V5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul5Q9D5V5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul5Q9D5V5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul5Q9D5V5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul5Q9D5V5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul5Q9D5V5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul5Q9D5V5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cul5Q9D5V5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cul5Q9D5V5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1453.9 ms