Protein–RNA interactions for Protein: Q9D593

Atp6v1e2, V-type proton ATPase subunit E 2, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1e2Q9D593 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp6v1e2Q9D593 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp6v1e2Q9D593 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp6v1e2Q9D593 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp6v1e2Q9D593 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp6v1e2Q9D593 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp6v1e2Q9D593 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp6v1e2Q9D593 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp6v1e2Q9D593 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp6v1e2Q9D593 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp6v1e2Q9D593 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp6v1e2Q9D593 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp6v1e2Q9D593 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp6v1e2Q9D593 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp6v1e2Q9D593 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp6v1e2Q9D593 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp6v1e2Q9D593 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp6v1e2Q9D593 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp6v1e2Q9D593 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp6v1e2Q9D593 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp6v1e2Q9D593 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp6v1e2Q9D593 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp6v1e2Q9D593 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp6v1e2Q9D593 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp6v1e2Q9D593 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp6v1e2Q9D593 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp6v1e2Q9D593 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp6v1e2Q9D593 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp6v1e2Q9D593 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp6v1e2Q9D593 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp6v1e2Q9D593 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp6v1e2Q9D593 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp6v1e2Q9D593 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp6v1e2Q9D593 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp6v1e2Q9D593 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp6v1e2Q9D593 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp6v1e2Q9D593 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp6v1e2Q9D593 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp6v1e2Q9D593 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp6v1e2Q9D593 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp6v1e2Q9D593 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp6v1e2Q9D593 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp6v1e2Q9D593 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp6v1e2Q9D593 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp6v1e2Q9D593 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp6v1e2Q9D593 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp6v1e2Q9D593 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.4 ms