Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efhc2Q9D485 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efhc2Q9D485 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efhc2Q9D485 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efhc2Q9D485 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efhc2Q9D485 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efhc2Q9D485 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efhc2Q9D485 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efhc2Q9D485 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Efhc2Q9D485 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efhc2Q9D485 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Efhc2Q9D485 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Efhc2Q9D485 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efhc2Q9D485 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Efhc2Q9D485 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Efhc2Q9D485 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efhc2Q9D485 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efhc2Q9D485 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efhc2Q9D485 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efhc2Q9D485 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms