Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1M4

Eef1e1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eef1e1Q9D1M4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eef1e1Q9D1M4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eef1e1Q9D1M4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eef1e1Q9D1M4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eef1e1Q9D1M4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eef1e1Q9D1M4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eef1e1Q9D1M4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eef1e1Q9D1M4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eef1e1Q9D1M4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eef1e1Q9D1M4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eef1e1Q9D1M4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eef1e1Q9D1M4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eef1e1Q9D1M4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eef1e1Q9D1M4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eef1e1Q9D1M4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eef1e1Q9D1M4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eef1e1Q9D1M4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eef1e1Q9D1M4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eef1e1Q9D1M4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eef1e1Q9D1M4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eef1e1Q9D1M4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eef1e1Q9D1M4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eef1e1Q9D1M4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eef1e1Q9D1M4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eef1e1Q9D1M4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eef1e1Q9D1M4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eef1e1Q9D1M4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eef1e1Q9D1M4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms