Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX92

Gje1, Gap junction epsilon-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gje1Q9CX92 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gje1Q9CX92 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gje1Q9CX92 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gje1Q9CX92 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms