Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pard3bQ9CSB4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pard3bQ9CSB4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pard3bQ9CSB4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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