Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE6

Asf1a, Histone chaperone ASF1A, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1aQ9CQE6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Asf1aQ9CQE6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Asf1aQ9CQE6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asf1aQ9CQE6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms