Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Med4Q9CQA5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Med4Q9CQA5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Med4Q9CQA5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Med4Q9CQA5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Med4Q9CQA5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Med4Q9CQA5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Med4Q9CQA5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Med4Q9CQA5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Med4Q9CQA5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Med4Q9CQA5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Med4Q9CQA5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Med4Q9CQA5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Med4Q9CQA5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Med4Q9CQA5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Med4Q9CQA5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Med4Q9CQA5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Med4Q9CQA5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Med4Q9CQA5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms