Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mrpl49Q9CQ40 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrpl49Q9CQ40 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms