Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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