Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Thumpd1Q99J36 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Thumpd1Q99J36 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Thumpd1Q99J36 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Thumpd1Q99J36 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms