Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbox1Q924Y0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Bbox1Q924Y0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbox1Q924Y0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbox1Q924Y0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbox1Q924Y0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms