Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpe65Q91ZQ5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpe65Q91ZQ5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpe65Q91ZQ5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpe65Q91ZQ5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpe65Q91ZQ5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpe65Q91ZQ5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpe65Q91ZQ5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Rpe65Q91ZQ5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpe65Q91ZQ5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpe65Q91ZQ5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Rpe65Q91ZQ5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpe65Q91ZQ5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Rpe65Q91ZQ5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpe65Q91ZQ5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpe65Q91ZQ5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpe65Q91ZQ5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Rpe65Q91ZQ5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpe65Q91ZQ5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Rpe65Q91ZQ5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Rpe65Q91ZQ5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Rpe65Q91ZQ5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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