Protein–RNA interactions for Protein: Q91YW3

Dnajc3, DnaJ homolog subfamily C member 3, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc3Q91YW3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajc3Q91YW3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajc3Q91YW3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dnajc3Q91YW3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc3Q91YW3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc3Q91YW3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms