Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdk5rap2Q8K389 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdk5rap2Q8K389 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms