Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Ssh3Q8K330 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ssh3Q8K330 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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