Protein–RNA interactions for Protein: Q8K221

Arfip2, Arfaptin-2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip2Q8K221 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arfip2Q8K221 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arfip2Q8K221 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arfip2Q8K221 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arfip2Q8K221 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arfip2Q8K221 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Arfip2Q8K221 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Arfip2Q8K221 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arfip2Q8K221 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arfip2Q8K221 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arfip2Q8K221 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms