Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH72

Trim32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim32Q8CH72 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim32Q8CH72 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim32Q8CH72 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.7 ms