Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ercc8Q8CFD5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc8Q8CFD5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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