Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Klf17Q8CFA7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.9 ms