Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A430089I19RikQ8C9W1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms