Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ClmnQ8C5W0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClmnQ8C5W0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms