Protein–RNA interactions for Protein: Q8C561

Lmbrd2, LMBR1 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd2Q8C561 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lmbrd2Q8C561 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbrd2Q8C561 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms