Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Defa22Q8C1N8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa22Q8C1N8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa22Q8C1N8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa22Q8C1N8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa22Q8C1N8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa22Q8C1N8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa22Q8C1N8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa22Q8C1N8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa22Q8C1N8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa22Q8C1N8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa22Q8C1N8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa22Q8C1N8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa22Q8C1N8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa22Q8C1N8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa22Q8C1N8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa22Q8C1N8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa22Q8C1N8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa22Q8C1N8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa22Q8C1N8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms