Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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Usp38Q8BW70 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp38Q8BW70 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp38Q8BW70 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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