Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia2Q8BSS9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia2Q8BSS9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia2Q8BSS9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia2Q8BSS9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia2Q8BSS9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia2Q8BSS9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia2Q8BSS9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia2Q8BSS9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia2Q8BSS9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia2Q8BSS9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia2Q8BSS9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia2Q8BSS9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia2Q8BSS9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia2Q8BSS9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia2Q8BSS9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia2Q8BSS9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia2Q8BSS9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia2Q8BSS9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia2Q8BSS9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia2Q8BSS9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia2Q8BSS9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia2Q8BSS9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia2Q8BSS9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia2Q8BSS9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia2Q8BSS9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia2Q8BSS9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia2Q8BSS9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia2Q8BSS9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia2Q8BSS9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia2Q8BSS9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia2Q8BSS9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia2Q8BSS9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia2Q8BSS9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia2Q8BSS9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia2Q8BSS9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia2Q8BSS9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia2Q8BSS9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia2Q8BSS9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfia2Q8BSS9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfia2Q8BSS9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms