Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG7

Rab3gap2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap2Q8BMG7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rab3gap2Q8BMG7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rab3gap2Q8BMG7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rab3gap2Q8BMG7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rab3gap2Q8BMG7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rab3gap2Q8BMG7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rab3gap2Q8BMG7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rab3gap2Q8BMG7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rab3gap2Q8BMG7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms