Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Htatsf1Q8BGC0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Htatsf1Q8BGC0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
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