Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otop3Q80UF9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Otop3Q80UF9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Otop3Q80UF9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms