Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPC1

Cdsn, Corneodesmosin, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdsnQ7TPC1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CdsnQ7TPC1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms