Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M2Q6W9L1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M2Q6W9L1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M2Q6W9L1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M2Q6W9L1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M2Q6W9L1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M2Q6W9L1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M2Q6W9L1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M2Q6W9L1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M2Q6W9L1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M2Q6W9L1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M2Q6W9L1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M2Q6W9L1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M2Q6W9L1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M2Q6W9L1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M2Q6W9L1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M2Q6W9L1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M2Q6W9L1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M2Q6W9L1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2-M2Q6W9L1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2-M2Q6W9L1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-M2Q6W9L1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms