Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn5Q6VZZ7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn5Q6VZZ7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn5Q6VZZ7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn5Q6VZZ7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn5Q6VZZ7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn5Q6VZZ7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Opn5Q6VZZ7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms