Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chd4Q6PDQ2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chd4Q6PDQ2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chd4Q6PDQ2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chd4Q6PDQ2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms