Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arhgap20Q6IFT4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms