Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zic2Q62520 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zic2Q62520 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zic2Q62520 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zic2Q62520 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zic2Q62520 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zic2Q62520 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zic2Q62520 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zic2Q62520 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zic2Q62520 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zic2Q62520 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zic2Q62520 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zic2Q62520 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zic2Q62520 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zic2Q62520 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zic2Q62520 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zic2Q62520 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zic2Q62520 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zic2Q62520 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zic2Q62520 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zic2Q62520 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zic2Q62520 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zic2Q62520 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms