Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Taf6Q62311 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf6Q62311 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms