Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mkrn3Q60764 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mkrn3Q60764 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mkrn3Q60764 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms