Protein–RNA interactions for Protein: Q5UKY4

Cd200r3, Cell surface glycoprotein CD200 receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200r3Q5UKY4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd200r3Q5UKY4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms