Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tsr1Q5SWD9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms